世界最顶尖的侦探学校“青蓝（BLUE）”，曾经有一位前途无量的稀世天才，那就是被称为青蓝创办以来最富天资之人——鸭乃桥论。而他却因为校内的某个事件，患上了作为侦探的致命“缺陷”，被逐出青蓝，并被禁止从事侦探工作。其后的五年，论一直在失意与百无聊赖中度日。直到有一天，警视厅搜查一课的刑警·一色都都丸前来请他协助侦破连环杀人案，论停止的时间再次开始流动。一色都都丸知晓论的烦恼，热心地提出协助他，是个“单纯的傻瓜”。论称呼都都丸为“都都”，感觉与他的合作蕴藏着无限的可能性，便任命都都为自己的助手。这对略有隐情且反差巨大的侦探搭档，将一个又一个神秘案件华丽地侦破……

在世界顶尖侦探学校·青蓝被誉为天才的鸭乃桥论，因患上某个致命“缺陷”，被剥夺了成为侦探的资格。在度过一段怀才不遇的岁月后，与警视厅搜查一课的一色都都丸——外号“都都”的相遇，极大改变了他的命运。论负责解谜，都都负责侦查，他们接连侦破疑难案件，逐渐成为了名搭档。青蓝内部也有论的理解者在两眼发光地关注着他的动向。其中一人就是校长艾梅利希。她告诉论，导致他被开除的“染血实习案”是一个圈套。其幕后主使，是制造了众多悬案的“史上最凶恶的犯罪一族”——M家，家主名叫麦罗·莫里亚蒂。为了给予论更大的绝望，麦罗将妹妹·温特派往了日本。论与麦罗之间究竟有何恩怨？